Bibliotēka ir dibināta kā augstskolas bibliotēka 1939. gadā, pamatojoties uz Ministru kabineta 1938. gada 20. decembrī pieņemto un Valsts Prezidenta Kārļa Ulmaņa izsludināto likumu „Jelgavas Lauksaimniecības akadēmijas satversme”.

LLU FB ir Latvijas Lauksaimniecības universitātes struktūrvienība. Bibliotēkas misija ir Latvijas lauksaimniecības un lauku ilgtspējīgas attīstības sekmēšana, nodrošinot kvalitatīvu pieeju informācijai lauksaimniecībā un tās saskarnozarēs ikvienam interesentam mācību, pētniecības, konsultatīvās un praktiskās darbības īstenošanai.
Bibliotēkas pienākumi izriet no tā, ka LLU Fundamentālā bibliotēka ir gan augstskolas, gan lauksaimniecības un tās saskarnozaru galvenā un lielākā bibliotēka Latvijā. Kopš 1994. gada LLU FB ir Apvienoto Nāciju Pārtikas un lauksaimniecības organizācijas lauksaimniecības informācijas sistēmu AGRIS un CARIS nacionālais centrs Latvijā, kā arī Starptautiskā lauksaimniecības bibliotēku tīkla AGLINET dalībniece. Kopš 1998. gada LLU FB ir arī Apvienoto Nāciju Pārtikas un lauksaimniecības organizācijas depozītbibliotēka.